产品成本高
除了聚乳酸在性能上的缺陷外，聚乳酸与普通塑料产品的价格差异大，聚乳酸产品的高价格影响了其工业市场的发展。一般情况下，聚乳酸价格比传统塑料要高50%～200%，以塑料袋为例，聚乳酸的密度是1.24g/ml，PE和PP的密度是0.9g/ml，达到同样的强度，聚乳酸袋要比PE或PP塑料袋更厚，需要更多的原料，因此，聚乳酸塑料袋比PE或PP塑料袋贵1倍以上，许多超市自然不愿免费为顾客提供这样昂贵的购物袋。同样，在农用膜应用领域，与PE的成本差别使聚乳酸材料难以被农民接受。
投入及入市风险大
在不好判断市场效益、技术也不是很完善的时候，建造聚乳酸工厂的前期投入大，风险也大。
由于具有不同的性能，聚乳酸产品的加工需要企业对其工艺进行频繁测试，来调整加工设备、优化加工条件。例如为了避免聚乳酸在加工过程中降解，需要更换热媒来适应较低的操作温度以避免聚乳酸过热，还需要用除湿器来控制湿度等。
聚乳酸材料的实验室制备工艺相当普及，但是要建立高质量、低成本、商业化可行的工业级聚乳酸厂却并不容易。对于不少企业来说，在没有市场、技术不成熟以及有可能存在侵权的情况下，投资聚乳酸建厂的风险较大。
甄光明分析说，在聚乳酸没有较大市场和竞争力的情况下，加工商不愿意改变设备、买料试车、调整工艺和加大产能来发展聚乳酸产品及其市场，而小规模生产会造成较高的生产成本和产品质量的不稳定，使其很难扩展市场。在这种情况下，共混企业、加工企业、分销企业以及整个供应链很难扩大市场规模，造成“没鸡就没蛋、没蛋就没鸡”的恶性循环。
自性能有缺陷
作为较硬的热塑性塑料，聚乳酸的性能与PET及PS比较相似，与PE及PP差异较大，它有很多独有的特性，比如良好的透明性、良好的表面光洁度、高硬度和较好的印刷显示效果。但是，聚乳酸也有很多特性限制了其在纺纤、注塑制品、泡沫塑料、衬垫包装以及食品包装领域的应用，在高附加值应用领域的使用也受其机械性能、热变形温度、气体穿透性、耐久性等性能的限制。
受自身特性和加工条件的影响，聚乳酸产品可以是非结晶、部分结晶和全结晶状态，这些状态会影响产品的热变形温度及强度，不少聚乳酸产品使用普通的非结晶型聚乳酸（aPLA），由于aPLA热变形温度在55℃左右，这就会限制其在电子器件、热餐容器或汽车部件等高温环境中应用。
在电脑、电子电气及汽车行业等高附加值应用领域，聚乳酸的防火性、耐用性是必须具备的，但是聚乳酸在温度58℃左右，湿度80%～90%以上的工业级堆肥条件下会快速降解，因此如果不经过共混改性，聚乳酸就不能满足高附加值应用领域的耐久性要求。
另外，聚乳酸的很多机械性能不如PE和PP等传统塑料，比如聚乳酸撕裂强度低、弹性差，在使用购物袋、垃圾袋和农膜等产品时，老百姓更愿意选择PE或PP材料的。另外，聚乳酸的阻隔性比PE和PP高许多，虽可用于鲜奶及矿泉水的盛装，但是不能用于需要长期储存的物质，如矿泉水或碳酸类饮料的包装等。
共混改性工艺在扩大聚乳酸应用到高附加值产品和弹性膜类产品上极为重要，但是目前国内成型聚乳酸制品的加工技术、成型设备、模具、辅助材料、标准及检测等都不完备，跟不上聚乳酸市场快速需求，从研究和技术方面完全滞后于传统以石化为资源的材料产业。再一个问题是高校及研究机构的科研成果不能及时很好的转化，企业与科研高校单位没有很好平台，缺少产业化型示范基地及保障制度和运行体系，这些都在很大程度上限制了这一朝阳产业快速发展。
政策法规不成熟
政府促进聚乳酸产业政策力度不够是市场推广受阻又一原因。2008年我国政府颁布了“限塑令”，规定超市、商场等不得使用免费的塑料袋，但是限塑令实施3年来，我们看到商家偷偷向顾客提供免费塑料袋的现象比比皆是，再加上不少消费者逐渐适应收费塑料袋，致使塑料袋的使用数量并未从根本上降下来。“限塑令”的负面效应未来也许还会出现很多。毕竟，“限塑令”非“禁塑令”，并不是长久之计。
与之不同的是，许多发达国家都制定了严格的法规来明令禁止使用传统塑料垃圾袋，或者为可降解塑料提供税收减免和补贴，例如德国在2007年制定的绿点税收政策（GreenDot）对传统塑料征收抛置费1.27欧元/千克，有欧盟OKCompost认证等降解证明的塑料可申请免税或减税；日本政府规定2020年前要以250万~300万吨的生物基塑料取代20%的石油基塑料。
一位不愿透露姓名的业内专家指出，政府的大力支持可以促进公众觉悟转变，公众觉悟转变又能激活聚乳酸市场。中国政府的限塑力度还远远不够，甚至连一个量化的目标都没有明确，这与发达国家还有很大差距。
低碳生物材料产学研创新联盟副秘书长张向南说：“缺少政策的支持，聚乳酸就很难进入塑料袋等低价、大量、价格敏感型产品的市场。但是，这些政策的执行还是不够彻底，在加强和推动使用聚乳酸及其他环境友好塑料产品上显得力不从心。”
回收及堆肥机缺失
在前不久召开的生物塑料业界论坛上，与会专家一致表示，目前我国还没有建立一套成熟的聚乳酸产品堆肥和回收机制。专家表示，聚乳酸废弃物能够通过燃烧、化学回收、填埋等方法来处置，但是更明智的方式是采用机械回收和堆肥。聚乳酸材料不会在普通条件下有效降解，它需要在工业堆肥环境下经过数月才能降解。若没有合适的垃圾收集和分选系统，聚乳酸废弃物进入垃圾填埋厂后是不能降解成堆肥回用的，但是，国内聚乳酸废弃物目前还没有足够的用量来建立类似PET及其他塑料的回收体系。
甄光明说，由于缺乏生物塑料贴标方法，人们往往不能将聚乳酸和其他塑料进行分拣，这样就会造成回收的PET瓶中混有聚乳酸塑料，从而影响回收料的纯度和品质，如果聚乳酸的回收比例超过0.1%，将会严重影响PET瓶等大量传统塑料的回收过程。
